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Table 4 Nucleotide sequences of the new F17 variants genes f17Ae , f17fAf and f17G3

From: Identification and detection of three new F17 fimbrial variants in Escherichia coli strains isolated from cattle

Variant gene

Nucleotide sequence

GenBank accession number (nucleotides)

f17Ae

ATGCGGAAAATTCAATTTATCCTTGGAATACTGGCGGCTGCGTCATCTTCTGCTACGCTTGCTTATGACGGTACAATTACTTTTAATGGAAAAGTTGTTGCTCAGACTTGTTCTGTTTCATCAGGAAGCAAGAATTTAACCGTTACATTACCGACTGTTTCTGAAGCTTCATTGGCTGCCGCAACAAATACTGCAGGTCTGACTCCATTTACCATTGAGCTGACCGGGTGTGATACCAATGCAGCTTCTGGTGCTCAGAACGTAAAAGCTTATTTTGAACCTAACGCCACGACTGATTACGATACGGGTAATCTAAATATTGCTGCCAGTGGTGCAAATAACGTTCAGATACAGCTTCTAAATGCAGATGGAGTTACTCCAATAAAACTAGGCCAAGATGCTACAGGACAGAATGTTACAGCTGTACAGATTGATAACGCAGCTATGAAACTGCGTTATAATGCACAATATTATGCCACAGCTCAGGCTACAGCTGGTGATGTCTCTGCCACAGTAAATTACACCATCGCGTATCAGTAA

AFDZ01000020.1 (420293-420832)

f17Af

ATGCAGAAAATTCAATTTATCCTTGGAATACTGGCGGCTGCGTCATCTTCTGCTACGCTTGCTTATGACGGTACAATTAATTTTACTGGGAAAGTCGTTGATCAAACTTGTTCTGTTACTACAGGAACCGCTCCCTTGGCAGTTACACTACCAACTGTCTCCACAAAATCATTAGATTCAACCGGGAAGGTAGCAGGCCTTACTCCTTTCACAATTTCACTGAGTGGGTGTAATACTGCTGCCGCTACAGGAGCTCAAAGTGTGAAGGCTTATTTTGAGCCTAATGCGACCACTGATTATGATAGCCATAACCTTAATATTTCAAGTAGTGGCTCTGGTAACGCAACAAATGTCCAGATTCAGCTTCTGAATGCTGATGGTACCACACAGATACTACTTGGTAATGATTCTGCTACTCAGGGAGTAACACCTGTTGTTATTAATAATGACGCAATGACATTGCGTTATAACGCACGGTACTATGCAACAGGTCAGGCCACCGCCGGCAACGTTTCTGCCACTGTGAATTACACCATCGCTTATCAGTAA

CP001162.1 (9749-10297)

f17G3

ATGATTTTCAGATATATCAGATTATTTTTAGTTGTACTTTGCAGTGTTGTTCTGGTTGACAGGGGAAACGCAGCATCTTTGTTTAATATCACGTTTGTCGGTAATGCTGAACAAACAATCACACCATCATCTGCATATACACTGACGCATGCAATGGATAATCTGCCTTACGTGTTCGATGAGGCGGGAGTAACTATTGGTTATTCCGCGGTTACTGTCTGGCAATATCCACGAGGGGTAAGAGTGTGTGCCGGGCTTGATGCAAAAGTTGGTTTACCCGTAGTGGGTAGCATTAATGGTCAGGATATCTATGGCGTCACTGATGAAGTGGGGCTGCTGGTATGGATGGGGGATGCCGGATATTCAGATGATGTTGCAATGACCGGAAATACGTGGACAAATGTACTGGATTCATGGTGTACAGCAAACGTTCCTCCAACGAGCCAGGGACTATCCCTTTATGTAAAACCTGTCATTCTTAAAAGAAGTACTACTGCTTCTTATGTTATCCCTCAGACGACAATAGGTAGTATTAAGTTTCGTCTGGAAGATGGGCCAAATAGTGGATATGAAACAACTGTCAATTTTACACTCAGTAGTTTTACGATTAACAATACAGTCACATCGTGCAGACTGTTGACGCCGGCATCCGTCAATGTTGCATTGCAGGACGTTTTTGTCAGTCAGTTTCCCTCTTCCGGTGATGAGGTTGCAGCCGGCTCCACGACGTTGCGGCTGCAGTGTGATGCAGGAGTGACGGTATGGGCAACACTGACTGATGCGACCACACCGTCCAACAGAAGCGATATACTCACACTGACGGGGGCATCGACTGCAACCGGAGTCGGGCTGAGAATATACAAGAACACTGACAGTTTGCCCCTGAAGTTTGGACCTGATTCGCCGGTAAAGGGAAATGAAAACCAGTGGCAGTTATCGTCAGGGACGGAAACGTTGCCCTCAGTTACCCTGAATGTAAAGTATGTTAATACCGGTGAGGGAATTAATCCGGGTACGGTCAACGGAATATCAACATTTACGTTTTCCTATCAGTAA

AFDZ01000020.1 (424180-425235)

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Veterinary Research

ISSN: 1297-9716